در حال حاضر دانشگاه علوم پزشکی ایران دارای 12 دانشکده و 91 گروه آموزشی می باشد .
| گروه های آموزشی دانشگاه علوم پزشکی ایران |
| اپیدمیولوژی |
| اتاق عمل |
| اخلاق پزشکی |
| ارتوپدی |
| ارتوز و پروتز |
| ارگونومی |
| ارولوژی |
| اعتیاد |
| اقتصاد سلامت |
| انگل شناسی و قارچ شناسی |
| ایمنی شناسی |
| آسیب شناسی |
| آمار زیستی |
| آموزش بهداشت و ارتقاء سلامت |
| آموزش پزشکی |
| آناتومی |
| بهداشت جامعه |
| بیماری‌های داخلی |
| بیماری‌های عفونی و طب گرمسیری |
| بینائی سنجی |
| بیهوشی |
| بیوتکنولوژی |
| بیوتکنولوژی |
| بیوشیمی |
| پرستاری کودکان و روان پرستاری |
| پزشکی اجتماعی و خانواده |
| پزشکی قانونی |
| پزشکی مولکولی |
| پزشکی هسته‌ای |
| پزشکی ورزشی |
| پوست |
| تکنولوژی رادیولوژی و رادیوتراپی |
| جراحی پلاستیک، ترمیمی و سوختگی |
| جراحی عمومی |
| جراحی مغز و اعصاب |
| چشم پزشکی |
| داخلی و جراحی |
| داروسازی بالینی |
| داروسازی سنتی |
| رادیوآنکولوژی |
| رادیولوژی |
| روانپزشکی |
| روانپزشکی جامعه نگر (سالمندشناسی) |
| روانپزشکی و علوم رفتاری کاربردی (روانشناسی سلامت) |
| روانشناسی بالینی و کاربردی |
| زبان انگلیسی |
| زنان و زایمان |
| زیست فناوری پزشکی |
| ژنتیک پزشکی |
| سلامت در بلایا و فوریت‌ها |
| سلامت روان |
| شنوایی شناسی |
| شیمی دارویی |
| طب اورژانس |
| طب سالمندی |
| طب سنتی |
| طب فیزیکی و توانبخشی |
| طب کار |
| علوم اعصاب |
| علوم آزمایشگاهی |
| علوم پایه توانبخشی |
| علوم تغذیه |
| علوم سلولی کاربردی |
| علوم و فناوری تصویر برداری پزشکی (گرایش تصویربرداری مولکولی) |
| فارماسیوتیکس |
| فارماکوگنوزی- بیوتکنولوژی دارویی |
| فارماکولوژی |
| فارماکولوژی- سم شناسی |
| فیزیک پزشکی |
| فیزیولوژی |
| کاردرمانی |
| کاردیولوژی |
| کتابداری و اطلاع رسانی پزشکی |
| کودکان |
| گفتار درمانی |
| گوش، گلو، بینی و سر و گردن |
| مامایی، بهداشت باروری و بارداری |
| مدیریت اطلاعات سلامت |
| مدیریت پرستاری |
| مدیریت توانبخشی |
| مدیریت خدمات بهداشتی و درمانی |
| معارف اسلامی |
| مهندسی بافت |
| مهندسی بهداشت حرفه‌ای |
| مهندسی بهداشت محیط |
| میکروب شناسی |
| نانو تکنولوژی پزشکی |
| نورولوژی |
| هماتولوژی و انتقال خون |
| هوشبری |
| ویروس شناسی |